在中国货主提供的马士基《通知》中，记者看到，涉及上调的费用包括：手工制单费（MDF）、文件费（ODF）、船证费 （CER）、电放费（TLX）、调换单费（SWC）、提单修改费（AMF）、超重罚款（HWS）和起运港港口操作费（OHC）。
在8个项目中，前6项“单证费用”被中国货主质疑为重复收费，其中文件费、船证费、电放费均由旧费率125元（人民币，下同）/提单提高到新费率200元/提单，涨幅达60%。
厦门瀛海实业发展有限公司董事长、厦门市集装箱运输协会副理事长蔡远游对 《每日经济新闻》解释称，“单证制作费用”是船公司的经营成本之一，不能以任何形式向托运人收取，否则属于重复收费，托运人可以拒付。“托运人如果担心不支付这些费用船公司会拒签提单，还可以在当地海事法院申请‘海事强制令’，要求船公司签发提单；或者先支付，采取证据保全，再诉讼索回。”蔡远游表示。
也有货主对记者反映，对于“电放”、“改单”这类附属服务，通常只能按照成本加适当管理成本收取，而马士基此次调整后，所收取的每提单电放费200元、调换单费700元、提单修改费200元在行业中偏高，也存在一定的不合理性。
而关于此次同时上调的“起运港港口操作费”，在业界和法律界则一直备受争议，此费用连同起运港收获费 （ORC）和码头作业费（THC），被认为在班轮条款 （CY－CY）下，属于海运费组成部分，若再加征收即为重复收费。
此外，马士基从2005年5月起，在中国口岸收取的每柜50元的“中国大陆地区设备操作管理费”也被视为带有严重的歧视性。
