随着我国疫情逐步好转，生产生活逐渐恢复正常，各省市陆续进入疫情管控后的复工复产阶段，为助力复工复产，南航新疆分公司陆续恢复多省市的通航航线，搭建复工复产空中通道。从3月中下旬开始，南航在新疆市场日均承运旅客突破1.8万人次。
国内干线方面：乌鲁木齐至北京、上海、广州、成都、深圳、西安等35个城市都已正常通航。其中乌鲁木齐出发抵达北京、广州、上海、西安、成都等主要城市已在原有航班量上进行加密，以乌鲁木齐至北京市场为例，每日航班已由疫情期间的1-2班增加到5-6班。同时在重点城市如北京、广州、上海、成都等航点投入宽体客机，进一步增加可利用座位数。
疆内航线方面：已恢复乌鲁木齐至疆内11个机场的航班。对疆内旅客流动需求较大的航点，如喀什、和田、伊宁等加大航班密度。其中前往和田的航班已增加至每日5-6班，喀什6-7班，伊宁3-4班。同时恢复的还有从和田、喀什等地始发，不中转乌鲁木齐抵达西安、郑州等城市的航班，为旅客提供多样化的出行选择，同时减少时间成本。
预计3月23日之后，南航投入新疆市场的航班量达到每日150班次，日均投入座位数达到2.6万个。随着疫情的稳定控制，航班恢复的数量将会慢慢回到疫情前的正常水平，为全国各地间的复工复产及经济社会交流提供安全、快捷的交通运输通道。
