加快水运体系的可持续发展，不仅有利于构建现代低碳型综合运输体系，也有利于调整优化沿江沿河地区产业布局，推进节能减排和绿色发展。在全国政协十一届五次会议上，致公党中央就此提出，要推动内河航运科技水平，突出航道公益属性，落实航道建设资金，并加快航道法制化进程，为低碳交通发展和航道资源保护提供保障。
2011年4月，国务院发布《关于加快实施长江等内河水运发展的意见》后，致公党中央和交通运输部联合赴浙江、广东、四川等地，就低碳交通运输体系和港口航道发展情况进行了调研。他们发现，目前在推动港口航道发展过程中，存在一些不容忽视的问题：航运科技水平相对落后，航道法规保障体系不健全等。
对此，致公党中央建议，进一步加大科技创新力度，增加航运科技投入，将长江黄金水道建设纳入国家科技支撑计划项目；加快内河航运信息化进程，加快建立长江、珠江等内河干线数字航道系统和水运智能信息平台的建设。
致公党中央还提出，内河航道属公益性基础设施，以社会效益为主，且航道建设必须要有长期、稳定的资金投入保障。因此，建议规定各级政府对航道建设的资金投入和政策扶持义务，规定航道建设支出在政府财政支出中的比重，或者航道建设支出占GDP的比重，从而明确支持航道事业发展的资金政策；并鼓励社会资本投资，推动银行和水运业的合作；积极创新投融资体系，拓宽投资渠道，从而确保航道建设管理资金的长期稳定投入。
据了解，当前航道管理机制不顺，导致航道管理和水资源保护无法依法进行，而《航道法》的立法是解决上述问题的根本途径。致公党中央建议，应加快《航道法》的立法进程，早日颁布实施，有力保护航道资源，大力促进水运发展，推进我国节能减排与绿色发展。
