长三角港口群被视作最具有对标全球最高水平潜质的一体化领域。民盟中央指出，长三角具备成为世界级港口群的基础条件，目前亟需按照“规划引领、机制先行”原则，高起点谋划长三角港口群战略定位，制定协同发展规划。
民盟中央在向全国政协提交的提案中表示，长三角港口群在一体化推进过程中存在几个不足：各省市制定的港口发展规划较少考虑彼此衔接，存在低水平重复建设、重复开发问题;区域港口同质化竞争激烈，部分港口存在能力过剩、码头和业务结构不合理等问题;信息平台多样导致信息传递迟滞，影响港口运作整体效率;跨地域港口合作受限于行政区划，缺乏更高层次、更大范围的合作机制。
民盟中央认为，应当本着“规划引领、机制先行”原则，高起点谋划长三角港口群战略定位，制定协同发展规划。一方面建立跨行政区港航统一监管机构，加强长三角港口群协同规划与长三角城市群发展规划、产业规划之间的衔接，实现互补错位发展;另一方面完善长三角港口协同治理机制，在长三角区域合作办公室下设长三角港口一体化合作办公室，研究跨区域港航建设、管理、规划等问题。
其次，要优化“两个体系”，打造绿色港航。优化集疏运体系，推动长三角内部公、铁、水集疏运通道建设，加强航运服务功能在区域内相互辐射的能力，推动航运资产、金融、保险、信息等要素市场一体化;构建“长三角”船舶排放标准体系，统一排放监管标准、探索绿色航运缓冲区。
第三，要强化战略，实现业务“两个协同”。强化港口与中远海运等大型航运企业的战略合作，开辟与“一带一路”沿线港口间的航线网络，推进长江航运资源优化配置和协同发展，利用自贸试验区在市场准入、税收、金融等方面的政策创新，完善现代航运服务体系;实施“港口+物流”“港口+贸易”“港口+信息”“港口+金融”战略，形成港航服务供应链网络，实现综合服务的竞争优势。
最后，要推进信息、利益“两个共享”，整合长三角港口群的政务、物流、通关等信息资源，建设长三角港口大数据平台，打造长三角港口公共服务平台;政府主导、市场化运作，在港口集团层面形成长三角地区之间的资本合作，实现业务运作的利益共享。
