为了因应两岸大三通，福州保税区规划在其辖内筹建“两马三通物流中心”，以期突破目前对台小额贸易局部、单向的局限，实现两岸货物双向直航，并实现大陆货物通过保税区进入马祖及台湾本岛市场。 

　　福州保税区江阴保税物流园区管委会副主任李平告诉记者，所谓的“两马三通”（台湾称之为“中三通”），其实就等同于一般性的进出口业务，是指两岸货运经由台湾到马祖，通过“两马”（马祖与马尾）海运直航运抵马尾港，再通过福州保税区集散分拨到大陆市场的双向流通的物流方式。 

　　李平表示，“两马三通”物流中心将实现台湾─马祖─马尾保税区─大陆的双向货物直航，从而改变目前“两马小三通”的局部、单向等多重限制，为两岸货物提供路线最短、成本最低、时间最快的物流服务。李平认为，“两马三通”物流中心将突破对台小额贸易定点、限额的局限，成为台货物流配送中心。 

　　据了解，该物流中心将由海峡两岸农产品物流中心、两岸快件包裹分拣中心和台湾商品展示展销中心等功能部门组成。届时，福州保税区将与马祖之间双向货物流通，货物可以直接备案进入保税区内仓储，以一般贸易方式报关进口后进入大陆市场；大陆的货物也可通过保税区进入马祖，再进入台湾市场。 

　　李平表示，保税区的原有优势将为该物流中心提供许多便利。比如，在陆台企生产、生活急需的原辅材料、耗料、机器维修零配件进入区内予以保税；对“两马三通”贸易方式进出的货物，不实行进出口配额、许可证管理；可建立台货展示交易中心，还可按海关有关规定出区办展；放宽海关对物流中心进出货物的外汇管制，无需办理出口收汇核销和进口付汇核销；允许人民币结算、核销等。 

　　据悉，马祖方面已多次赴榕考察调研，并与福州保税区进行了具体规划。目前，福州保税区已责成福州保税区两岸贸易有限公司具体负责实施。李平表示，现在只待两岸两会签署的相关协议生效以及“两马”地区相关行政部门的批准。