自5月份以来，特别是进入6月份，苏北运河航道一直处于低水位运行，通航安全形势严峻，通航效率明显下降。苏北航务管理处积极采取措施应对，全力以赴保畅通保安全。
该处通过网站、多媒体、公示栏、广播、短信等多种平台和方式，及时公布船舶限航有关规定和低水位过闸安全注意事项，对航道中搁浅的船舶，及时采取救助措施，尽快恢复畅通；根据水位变化，及时调整调度计划，采取限制大型超吃水船舶通过的方式，根据各梯级水位情况，实时调整放行适航船舶的吃水深度；实行相联船闸联动控制，启动《低水位运行期间安全防范预案》，对待闸船多的船闸，采取相邻航段调控手段，分级控制船舶，保证煤电油运尽可能优先及时通过；配合海事部门，共同排堵保畅，做好待闸船员解释工作，力所能及地为滞留船员提供服务。
