政府持有35.51%股权的阳明海运，出现十年以来最大亏损：高达158.41亿元，资本额亏掉了六成一，引起立委关切。
对此，阳明海运总经理何树生表示：去年运价收入减少四百二十六亿元，国际主要航商亏损都在美金五亿元以上。展望今年，亏损已经大幅减少，预估全年可望转亏为盈。
对此，阳明海运总经理何树生解释，去年受金融海啸，运能严重过剩，影响国际运价出现严重的崩盘，大跌五成，运价收入较前一年短少了四百二十六亿元，导致税后亏损，根据阳明的资料显示，去年全球第一大航商丹麦马士基亏损了美金20.8亿元，韩进亏损10.9亿美金，智利航运亏损6.69亿元，现代航运亏损了6.91亿元，东方海外亏损4.01亿元，换言之，主要货柜船公司都面临严重亏损。
阳明海运表示，所幸今年运价已经逐渐恢复，其中欧洲线已经恢复到前年的水平，预估美国线在第四季也会恢复到原有水平，再加上舱位减少，需求提升。第一季亏损已经大幅减少，预估全年可望转亏为盈。
至于国内另外一家主要航商：长荣海运，去年度财报四月底才公告，到去年第三季的数字是亏损了72.9亿元，同期阳明亏损超过百亿，预估长荣的亏损幅度少于阳明。
立委徐耀昌则是抨击，阳明过去几年大量高价购船，并且有多项不当的转投资事业，如高球场，饭店，等等，应该要追究责任。对此，何树生则表示：已经陆续在清理当中。目前也已经延后了20艘新船的建造合约并考虑将部分船型改为散装轮。