一、出口退税期滞后。由于 出口退税 期的不断变化， 出口退税 款迟迟不能到位，对出口企业尤其是对以出口为主的外贸企业来说，退税款被长期拖欠，企业资金无法正常运转，有的甚至只能靠银行借贷来维持，导致银行出口退税逾期，已经严重影响到银行的资产质量。
二、法律地位问题。从法律上讲，出口退税不是有效的担保，也就不具备抗拒第三方的功能。企业一旦破产或涉嫌偷骗税，这笔贷款就无法偿还。企业取得贷款后，如与第三方发生经济纠纷并诉诸法律时，该企业的出口退税账户可能被法院冻结，造成贷款无法偿还，使得银行的不良贷款率上升。
三、出口退税托管贷款期限短。出口退税托管贷款是企业凭有效的欠退税单据作为抵押，向商业银行申请贷款，但按照国家 规定 ，质押贷款最长期限是一年，虽然托管贷款是以税收作为担保，但由于目前退税款偿还越来越慢，从半年延长为一年，甚至超过一年。
四、利息偿还问题。利息部分由各地财政贴息80%，余下的20%由企业自付，但很少有地方财政能够拿出钱来为出口企业贴息。因此，银行担心贷款发放后会因利息问题而引发纠纷，从而增加不良贷款的比率。
五、退税证明出具问题。由于出口退税托管贷款需要提供有关部门的退税证明，而这项证明的出具有的是外经贸部门，有的是税务部门，有的是地方政府，标准很不统一，交易程序的复杂性使得银行对发放该项贷款态度谨慎。
为降低银行经营风险，保持出口退税托管贷款的可持续性，特提出以下几点改进建议。
一、国家应加快退税速度。出口退税款的滞后已经严重影响到银行的贷款质量，只要政府能按时还款，银行的风险就会相应降低。另外，出口退税的实际额度下达后，要及时拨给企业，让企业对退税款的调度使用有合理的预期，减轻企业的流动资金压力。
二、出口退税证券化。所谓证券化，就是政府对债权企业定向发行债券，企业可以拿这些债券去银行质押以获取资金，由于是政府发债，银行的风险相对减校另外，对出口退税证券化，可以 规定 一个偿还期限，这样，政府就可以有较充足的时间来偿还这些款项，既解决了企业的资金周转问题，又化解了银行的风险。
三、 规范出口退税托管贷款业务的操作。企业在申请该项贷款时，各相关部门应减少一些不必要的环节。同时，银税之间要建立沟通机制，税务机关定期将欠、漏税企业名单向银行通报，银行在对这些企业发放贷款时慎重操作。而最高法院也应出台司法解释，使出口退税账户托管贷款能有对抗第三者的法律效力。
四、 规范银行的贷款机制，规避信用风险。可采取封闭式的做法防范风险，即把出口退税托管贷款与该企业的新增业务联系起来，当出口退税托管贷款演变成不良贷款时，可由银行在其其他业务货款中扣除，从而将风险降到最低。
