长江三角洲地区近年来经济社会发展活跃,口岸外贸和海关税收均已占中国总量的四成。据海关总署统计,2006年,通过长三角口岸的进出口贸易达7147亿美元,比上年增长24.3%,约占全国外贸总额的41%,其中,约641亿美元的进出口来自长三角以外的其他省区市;上海、南京、杭州、宁波四大直署海关2006年完成税收2458亿元人民币,比上年增长11.4%,占全国海关税收总额的40.3%。
2006年,长三角四大海关共监管进出口货运量4.18亿吨,审核报关单1711万份,比上一年分别增长10.8%和20.2%,分别占全国总量的23.7%和38.5%。在深化通关作业改革方面,长三角地区海关近两年先后实施了提前报关、无纸通关、空运直通式通关、便捷通关、特定区域快速通关等项目。目前长三角地区海关网上税费支付业务已推广至12家银行,其中上海口岸税费电子化支付率已提高至72%。长三角共有8个沿海主要港口、26个内河规模以上港口。