前三季度港口业受累于外贸出口减缓和航运业不景气，货物吞吐量和集装箱增长幅度放缓，同时全国港口吞吐能力大幅增长竞争激烈影响，进入平稳增长时期。
06年前三季度，港口吞吐量的增幅与05年同期相比有一定的下降，但是与04年同期相比下降的幅度较大，尤其是货物吞吐量和集装箱。据中国港口协会统计，1-9月全国规模以上港口累计完成货物吞吐量337210万吨，同比增长18.3%；完成外贸货物吞吐量117224万吨，比去年同期增长17.2%；完成国际标准集装箱吞吐量6678.80万TEU，比去年同期增长22.9%；而05同期年货物吞吐量、外贸吞吐量、国际集装箱分别增长18.3%、19.2%、23.9%；04同期年货物吞吐量、外贸吞吐量、国际集装箱分别增长25.7%、 19.8%、27.2%。
从全国范围看新建泊位增多，港口吞吐能力大幅增长。06年上半年完成集装箱项目8个；完成煤炭码头7 个，原油码头1个，铁矿石码头2个。据交通部预测，到今年年底，全国沿海港口全年新开工项目166项，完成投资约600亿元，是整个“十五”期间完成投资的45%。将新增生产性泊位265个，新增吞吐能力5．48亿吨，总的吞吐能力将达到34．38亿吨。内河水运建设预计全年完成投资约220亿元，比去年增长95．6%，将新增港口泊位165个，新增吞吐能力1950万吨，新增三级以上航道418公里。
外贸出口增速趋缓，直接导致了集装箱的增速放缓。据海关统计，06年1-8月进出口贸易达到11064亿美元，同期增长23.9%。其中，出口5996亿美元，增长25.9%，较去年同期下降6.1%；进口5050亿美元，增长21.6%，上升6.7%。另外，一般贸易出口增长28.3%，较去年同期下降7%；加工贸易出口增长 23.1%，较去年同期下降5.7%。
此外，日益增多的贸易摩擦和人民币升值也在一定程度上抑制了外贸出口的增速。
资源的进口保持增长促进了港口散杂货业务的增长。资料显示，1-9月原油进口量1.09亿吨，同比增长16.2%；铁矿石进口1.99亿吨，同比增长31.6%；煤炭进口2615万吨，同比增加41.1%。
此外，原油、煤炭的出口有所下降，但出口的减少量少于进口的增加量。资料显示，1-9月原油出口量427万吨，同比下降21.8%，减少119万吨，而进口量增加了1520万吨；1-9月煤出口4807万吨，同比下降11.9%，减少649万吨，而进口量增加了762万吨。
由于国家鼓励资源的进口，抑制出口，所以预计资源的进口还会保持增长，出口仍会下降。财政部将从11月1日起调整部分进出口商品暂定关税税率。成品油、煤炭等26项资源产品进口税率由3-6%降为0-3%；原油、煤炭和焦炭等产品将加征5%的出口关税。
06年前三季度航运业仍处于不景气中，是吞吐量增幅放缓的主要原因。资料显示，中远航运、中海发展的业绩均有不同程度的下降。同时，据上海航运交易所资料显示，中国出口集装箱综合运价指数自05年下半年开始下滑，06年6月中曾跌破1000点，9月份指数是1025点，10月份虽然有小幅上扬至1055 点，但是总体来讲始终低迷；中国沿海（散货）综合运价指数06年来虽然一直在缓慢上升，9月底升到1550.72点，但是也始终处于低迷状态。同样的，波罗的海干散货运价指数（BDI）06年来也一直处于缓慢上升中，甚至10月份在4000点附近高位波动，但是比起04年6000点的高点，该指数目前还是较低的。
此外，港口的集疏条件越来越完善。资料显示，天津港25万吨级航道工程今年完成一期工程，07年将建成；黄万铁路已经开通，进港铁路也将于今年完成；上港集团则拥有高级公路网和铁路网，同时水运条件优越；深赤湾则在05年拆除了制约公司集装箱业务发展的平南铁路，改成了进出港道；另外，保税港的优惠政策正成为越来越多的港口城市努力争取的资源。继上海洋山港、天津东疆以及大连大窑湾之后，深圳盐田港有望成为国内第四个保税港区。据悉，深圳市政府正在整理材料，以向广东省和国家申报盐田港区设保税港区。
港口上市公司总体业绩平稳增长，其中上港集团起到了非常大的作用，但是剔除掉上港集团因数后，部分上市公司业绩是下降的，甚至出现了亏损。据世华财讯统计，前三季度，港口上市公司实现主营业务收入 147.02亿元，同比增长9.2%；净利润39.20亿元，同比增长16.5%，主营收入和净利润都是平稳增长，净利润的增长幅度较主营收入大；剔除上港集团后主营收入为57.02亿元，同比增长2.5%；净利润18.62亿元，同比增长11.2%，主营收入和净利润的增幅明显低了。另外，锦州港、芜湖港、S北海港、重庆港九、深赤湾5家公司的业绩分别下降16.71%、17.16%、113.92%、18.78%、4.56%，S北海港甚至是亏损 88.26万元。
集装箱内外贸费率都难以得到有效提高。集装箱外贸费率受沿海泊位快速投放的影响，吞吐供给增速快过需求增速，费率开始走低，或是通过给予其他优惠条件变相走低。资料显示，上港为了应对竞争，中转集装箱仅收200元/TEU，远远低于预期；盐田港则由于空箱及中转箱占比上升使得综合费率下降；天津港则干脆放弃了集装箱提价计划；另外，对集装箱港口来说，内贸装卸费率仅为外贸的50%左右，竞争的激烈使得港口保持低费率。天津港集装箱装卸费率在300元/TEU左右保持不变。
散杂货业务提价空间较集装箱大，但其毛利率低于集装箱业务。日照港今年将外贸煤每吨费率增加5.70元，上半年增加毛利1849万元；天津港则将煤每吨费率提高10%；此外，以上港集团为例，1-9月散杂货的毛利率是53.60%，而集装箱毛利率为66.58%。
大多港口上市公司的毛利率有所下降，主要的原因是主营成本增长略高于主营收入。其中，上港集团前三季度装卸业务毛利率63.5%，同比下降9.66%；营口港42.23%，同比下降0.98%；天津港49.49%，同比下降0.81%；深赤湾62.04%，同比下降3.29%；此外，盐田港交通运输业前三季度毛利率51.28%，同比下降23.1%；芜湖港的煤业务毛利率60.54%，同比下降4.56%。另外，据世华财讯统计，前三季度，港口上市公司主营成本70.83亿元，同比增长10%，略高于主营收入增幅；而剔除上港集团后，主营成本是27.03亿元，同比增长7%，同样高于剔除上港集团后的主营成本增幅2.5%。
最受关注的是上港集团的整体上市令公司资产得到有效扩张。资料显示，上海国际港务（集团）按1：4.5的比例换股吸收合并公司。以3.67元/股的价格发行股票作为换股吸收合并对价，换股价格为16.50元/股。换股后，公司将从原来单一的集装箱码头运营商转变为综合码头运营商，持有了洋山港一期泊位100%的股权和二期18%的股权，集装箱吞吐能力新增200万TEU，散货吞吐能力增加2400万吨。目前在建项目有罗泾二期、外高桥六期2个散货码头，预计07年投入运营，此外，规划项目则有外高桥七期、金山嘴港区建设在规划中。同时整体上市后上港集团还已经启动了海外码头收购计划，目前计划收购比利时泽布吕赫港一个集装箱码头的40%股份。
另外，大连港在上半年拟收购锦州港成功，东北港口面临整合。目前辽宁省主要有三个港口，其中锦州港作为矿产和能源的出口，营口港则作为东北粮食的出口，还有丹东港规模较小。大连港则具有油码头、集装箱及散货多元化业务。因此，资源整合、加强龙头地位不仅仅是大连港准备收购锦州港的目的，而且是辽宁省整合内部资源，形成核心竞争力的要求。资料显示， 9月22日，锦州港和大连港签署了《战略合作框架协议》。根据这份协议，大连与锦州两港将在资本市场、港口物流和锦州港西部海域开发建设等领域展开全面合作。作为战略投资合作伙伴，通过增资扩股等多种形式使大连港成为锦州港的股东，同时锦州港也可作为大连港的战略投资者。这就为今后大连港收购锦州港留下了一条道路。
其他港口上市公司的资产规模也取得一定扩张。盐田港三期工程06年中完成，盐田港占35%；同时在对西港区码头的增资中，盐田港占58.35%；深赤湾前三季度在前海兴建了一个集装箱的临时堆场和向大股东租用土地用作堆场，在一定程度上缓解了堆场不足的问题；并且公司拟以12亿元在东莞麻涌港建立2#--5#四个5万吨级散杂货泊位；营口港前三季度收购了三个油码头，目前在建有铁泊位和油品泊位，大股东已经表示全力支持上市公司发展，有资产注入预期；重庆港九受让了重庆国际集装箱码头公司5%的股权，主要的资产扩建项目是寸滩二期工程，预计09年完工；芜湖港的配煤工程项目在建中，同时朱家桥十万标箱码头也在积极准备开工；天津港的远航散货泊位在8月竣工投产，公司拟与新加坡集团共同设立天津港太平洋国际集装箱公司，在东疆保税港区建设北港池集装箱三期工程；锦州港在今年将有2个10万吨散货泊位、1个油泊位和1个工作船泊位竣工。而锦州港计划在05-08年建12个万吨级泊位，1个工作船泊位，09-2010年建2个万吨级泊位，可见锦州港的资产每年都将得到有效扩张。
此外，腹地经济发达的港口上市公司加大了建设枢纽港口的力度。长三角的上港集团整体上市后，进一步稳固了全球第一港口、第三大集装箱港口的地位，安排资本性支出达100亿元，通过实施长江、东北亚和国际化三大战略，力求保持集装箱产业持续健康发展；同时实现中转业务突破，确立和巩固上海国际航运中心地位；环渤海的天津港则是北方最大的散货主干港、国际物流和资源配置的枢纽港，计划投资270亿元建成东北亚枢纽港，并将重点发展集装箱业务。目前滨海开发和保税港区的建设将是公司发展枢纽港的良好机遇；珠三角的盐田港在和黄的帮助下，不断加强其在珠三角的集装箱的业务能力，资料显示，公司将联合和记黄埔对西港区码头增资7.54亿元；三期工程总投资70亿元，建设4个10万吨泊位，预计06年底全部竣工；而盐田国际三期扩建工程总投资114亿元，建设5个7-10万吨集装箱泊位， 1个3万吨集装箱泊位，首个泊位将于年底投产，2010年全面完成。
外资在港口业特别是集装箱码头中起了越来越重要的作用。目前，中国沿海和内河集装箱主要码头合资率分别占集装箱泊位总数和集装箱泊位总通过能力的64.2%和72.24%。原上海港务局与香港和记黄埔合资的上海集装箱码头有限公司，投资总额约为56亿元人民币，中外股权各占50%；大连港务局与新加坡港务集团、马士基航运有限公司合资的大连集装箱码头有限公司，投资总额约40亿元人民币；深圳盐田港集团与和记黄埔合资的深圳盐田国际集装箱码头有限公司，注册资本24亿港元，境外资本占73%。和记黄埔参与经营9 家港口，包括深圳盐田港、上海、北仑、厦门、汕头、江门等港口，与原上海港务局合资的上海集装箱码头有限公司，投资总额约为56亿元人民币，占50%，甚至控股盐田国际，06年前三季度以现金3.14亿元增资西港区集装箱码头；ＰＳＡ则由中北部港口大连一路发展到福州、广州，前三季度拟出资11.24亿元与天津港合作建设太平洋集装箱码头公司；大连港务局与新加坡港务集团、马士基航运有限公司合资的大连集装箱码头有限公司，投资总额约40亿元人民币。在沿海主要港口中，大连、秦皇岛、天津、青岛、上海、福州、厦门、汕头、深圳、珠海等港，以及长江的南京港、张家港港均早有中外合资集装箱码头。此外，广东地方港口中，共有中外合资集装箱码头企业37家，其中沪港合资企业30家，外商独资企业5家。
另外，民营资本也开始涉足港口投资甚至经营上市港口公司，但是在外资和国有资本的夹击下，民营港口的发展困难重重。锦州港由民营企业东方集团控股，但是政府却有意将控股权让给大连港；北海市政府则已经同意将S北海港的控股权转让给了天津民企德利得集团，但是该计划面临被广西区国资委取消的风险。
全国港口将根据腹地经济的特点，发展相应的港口设施。《长江三角洲、珠江三角洲、渤海湾三区域沿海港口建设规划（2004年～2010年）》于2004年经国务院审议通过。该建设规划范围为长江三角洲、珠江三角洲和渤海湾三个区域的沿海港口，以煤炭、原油、铁矿石和集装箱四大货类为主。
国务院已审议通过了《全国沿海港口布局规划》，确定了中国沿海将逐步形成五大区域的港口群，自北向南依次是环渤海地区、长江三角洲地区、东南沿海地区、珠江三角洲地区和西南沿海地区。规划将重点建设煤炭、石油、铁矿石、集装箱、粮食、汽车及物流、陆岛滚装、旅客八大运输系统。
同时，交通部的“十一五”规划提出防止重复建设港口和岸线资源浪费；将确定沿海各港口的定位和分工；从区域影响和专业分工角度规划我国港口建设和布局，形成“布局科学、结构合理、层次分明”的港口体系。
以上政策表明，集装箱业务将是中国港口建设的重点，特别是长三角、珠三角的港口。预计港口业将保持平稳增长。
港口吞吐量的增长是港口发展的最大动力。据交通部门权威预测，到2010年，我国港口年吞吐量将达到61亿吨，集装箱吞吐量将达到1.2亿至1.4亿 TEU。到2020年，全国沿海港口货物吞吐量将为目前的1倍左右，其中进出口货物的吞吐量将达到目前的1倍以上。与2010年需要相比，我国的港口总能力缺口在20亿吨以上，其中集装箱、煤炭、原油、矿石的接卸能力缺口分别为8200万标准箱、3.3亿吨、0.8亿吨、3.5亿吨。
“十一五”沿海港口发展目标重点指出：建设上海等国际航运中心；进一步完善沿海港口布局，建设集装箱、煤炭、进口油气和铁矿石中转运输系统，扩大港口吞吐能力。“十一五”沿海港口将新增吞吐能力80%以上，适应度接近1∶1。预计届时中国沿海万吨级港口将达到1750个。
