长江三角洲地区经济活跃、市场化程度高，是我国较早推行港口资源整合理念并率先付诸实践的地区。
早在1975年，为了配合金山石化项目，上海市在浙江省乍浦港建设了陈山原油泊位，首创了国内跨行政区域建设经营码头的先例，是港口资源整合的雏形。“九五”期间，上海宝钢集团在舟山北部马迹山岛建设大型铁矿石中转码头，并于2002年建成投产；为建设上海国际航运中心，开始研究上海与浙江联合在舟山大小洋山建设集装箱深水港区，洋山一期工程于2002年动工兴建，将跨行政区域建设经营港口又向前推进了一大步。
进入21世纪，从区域经济社会均衡协调发展的角度出发，浙江省政府开始积极推进宁波-舟山港口一体化发展；江苏省沿江江阴-泰州港一体化发展进展顺利；一些港口正在探索内部不同业主码头之间的兼并重组的途径，如张家港集团与保税区之间合作开发经营码头。表明本地区港口规划、建设和经营从思路上已经突破了传统框架，港口内部、跨行政区域港口资源的综合利用、合理整合取得了实质性进展，跨地区实现优势互补和大规模的港口资源整合进入了新的发展阶段。
