中小物流企业所存在的问题都不是孤立的，体制、治理结构、经营规模、内部管理以及政府对市场的监管等问题都相互影响，相互制约。这就使得企业不能就单独的问题而解决问题、治标不治本，而是要提升到企业整体的高度上来，从问题的根源出发，综合地解决问题。
首先要制定科学合理的发展战略。企业的发展不能单靠领导者的个人感觉，科学合理的发展战略对于中小物流企业来说是至关重要的。中小企业必须脱离领导者的个人感觉，制定科学合理的发展战略，明确企业的短、中、长期发展目标及方向。
企业的发展战略决定了企业以何种姿态参与市场竞争，一般说来企业会有三种选择。一是积极参与到大企业的价值链中去，建立长期的战略合作伙伴关系。二是选择产业链中大型物流企业经营的缝隙，实施高水平、差别化经营，获取区域的竞争优势。三是介于两者中间，形成以中介代理为核心的中小物流企业集群。有条件的中小物流企业也可借鉴发达国家的经验，寻找高质量的中介组织，借助中介组织的力量，以其为媒介，由其进行业务开发，组织信息服务，进行物流需求的区域调节和要求调节。
其次，要加强科学管理，提高企业竞争力。利用现代企业管理理念，结合当代物流发展趋势，加强科学管理，把中小物流企业在企业内部管理中的缺陷及不足纠正过来。
第一，中小物流企业特别是国有中小物流企业要更新观念，优化法人治理结构，切实解决因体制、内部治理结构而导致的问题。积极通过改制、兼并、股份制、引进投资等手段，使体制、治理结构得到优化，实现产权制度的全面转型，提升企业竞争力。
第二，中小物流企业还应制定详尽的经营计划及完整的财务体系，用以指导企业流程再造，指导企业以完善的科学管理体系来管理企业。经营计划是企业战略的细化，是实现企业战略的有效手段，中小物流企业应切实制定详尽的经营计划，把企业年度目标规划好，把企业的人、财、物管理好。
第三，中小物流企业要重视人力资源管理，加大对员工的培训力度，使员工具备完成本职工作所需的基本知识，了解企业的经营情况、发展战略，掌握与本职工作有关的必备技巧，培养员工对企业的忠诚，增强企业集体主人翁精神。同时，中小物流企业还要建立一套科学有效的绩效考核体系及激励机制，科学评价员工绩效，增强员工的积极性，增强企业的凝聚力。
另外，应加快物流信息化的建设。建立信息化是一项耗资、耗时巨大的工程，中小物流企业应根据自身具体情况以及企业的远景和目标来确定是否建立。当然，对于一些不具备实力或者不愿意在信息化建设上花高昂成本的企业来说，公共信息平台也是不错的选择。公共信息平台以较低的成本优势对行业资源进行整合，发挥物流行业的整体优势，实现了物流企业之间、企业与客户之间的物流信息及功能的共享。中小物流企业只要通过会员注册就可以加入公共信息平台，就能以较低成本开展网上业务，共享物流行业信息，拓宽业务范围。同时，中小物流企业还能利用公共信息平台网络优势，为客户提供全方位的物流信息以及个性化的物流服务。
