2014年，嘉兴内河港累计完成港口货物吞吐量10140万吨，同比下降约9%；完成集装箱吞吐量约14.7万标箱，同比增长3.2%，完成集装箱中转量15.7万标箱，同比增长3.8%。
嘉兴内河港受产业投资结构变化和环境污染治理进一步深化的影响，矿建材料和煤炭吞吐量出现较大幅度的下降；另外，海宁、海盐两地的矿建材料生产量下降以及三改一拆、码头整治工作的开展均是全市内河港口吞吐量下降的原因。
同时，嘉兴内河港大力发展集装箱运输，使得集装箱吞吐量比重增加。一是引进船公司，开发从嘉兴到太仓的外贸出口以及长江航线；二是创新“散改集”模式，使PTA等工业产成品比重上升；三是打造全省美丽码头，提升港口整体形象；四是提供就地通关报检等方便快捷的服务；五是推进“海河联运”发展。
