根据日本贸易振兴机构报告，2013年日本和巴林双边贸易额11.5亿美元，同比下降10.27%。日本与巴林贸易额占日本—海合会贸易总额的0.67%。
2013年，巴林自日本进口7.59亿美元，下降5.94%；巴林出口额4.75亿美元，同比下降17.63%。
日本与海合会贸易额1713亿美元，同比下降5.9%。其中，日本出口224亿美元，同比下降10.1%；日本进口1489亿美元，同比下降5.3%。
下降原因主要是出口商品价格下降、日本进口原油减少以及日元对美元贬值等。
日本对海合会主要出口汽车、通用机械和设备、电器、橡胶制品以及塑料制品，其中汽车占总出口额的60.7%。
