为确保敦煌机场飞行区扩建工程顺利实施，有效降低飞行安全风险，2017年2月14日民航西北地区管理局批复2017年3月15日至5月25日期间关闭敦煌机场。
2017年5月17日，敦煌机场扩建工程2800米跑道复航所涉及部分工程行业验收顺利通过，同意机场消防救援等级提升为6级。标志着敦煌机场基本具备复航条件。
敦煌机场扩建工程2800米跑道复航所涉及部分工程行业验收和机场消防救援等级提升符合情况检查，由民航西北地区管理局和民航甘肃监管局各部门监察员组成，下设飞行区工程组、航卫组、公安组3个小组。
验收小组通过现场检查和验收了2800跑道复航所涉及场道工程、目视助航设施工程及相应的运行管理制度等。并复核了竣工验收提出的整改问题。通过现场检查、验收和复核，认为工程质量复核设计要求和验收标准；工程竣工验收中提出的意见已基本整改完毕；工程主要设备安装、调试运转正常；工程档案资料收集基本齐全，保障机场安全运行各类规章制度基本齐全。机场消防救援、应急救护等级符合6级相关要求。经各验收小组讨论和审议，一致同意通过行业验收。（待预计5月21日增加2800米跑道助航灯光校飞）
敦煌机场扩建工程2800米跑道复航所涉及部分工程于2016年7月15日开工建设，2017年4月30日完工，5月6日通过竣工验收。此次敦煌机场扩建工程，按照满足2025年游客吞吐量96万人次、货邮吞吐量1700吨的目标设计，飞行区等级将由4C提升到4D并满足E类飞机备降。
为确保5月26日按期复航，复航后按2800米跑道运行安全、顺畅，进一步提升敦煌机场安全服务保障能力，建立安全生产运行长效机制，杜绝不安全事件发生，保证敦煌机场各项工作持续安全有效。敦煌机场公司召集公司各部门及驻场单位多次召开复航协调会，及时排除安全隐患、现场解决复航过程中存在问题。
自5月5日，公司提前20天全员到岗，熟悉新设施设备运行情况，掌握现目前面临的新站坪、跑道、联络道等新环境下各类应急预案流程，开展桌面演练与现场实践相结合。同时，结合公司实际情况制定下发了《敦煌机场2800米跑道复航工作实施方案》，成立协调领导小组，对各部门复航准备工作进一步明确和细化，罗列工作单，将工作细化到人，并且明确工作时限，全员发力，确保圆满完成复航工作。
现目前，5月26日起将恢复7条航线：
1、北京/上海=西安=敦煌（东航）Mu 2215/6 每天；
2、西安=敦煌（东航）Mu 9641/2 每天；
3、西安=敦煌=花土沟（东航）mu 2273/4，5·27执行（1246）
4、北京=敦煌（国航）6·1执行Ca 1287/8;
5、重庆=兰州=嘉峪关=敦煌（华夏航空）G5 2689/90（1235）
6、成都=兰州=敦煌（川航 1357）3U8569/70；
7、南京=兰州=敦煌（东航）Mu2749/50，6月20日开始执行。
（5月26日当天西安=敦煌5个加班，兰州=敦煌1个加班，东航A320执行。当天执行4个正班、6个加班，合计10个航班。）
以上航班已经全部上网销售！
