根据协定，中国不迟于2003年1月1日允许外资企业从事药品的零售，取消地域、数量限制，外商可在中国从事采购、仓储、运输、配送、批发、零售及售后服务——这是中美双方加入WTO签署的协议中涉及医药行业的5项承诺之一。当时，外界普遍认为商业企业有了这个缓冲期，或可以更加从容应对外资的进入。但实际上，药品分销领域的变革却没有因此而滞后，相反，在外资的催化下，内生的强大变革愈发异彩纷呈。
内生变革
有连串数据或可说明药品分销领域变革的热度——入世前，医药商业前三强在医药市场的销售比重约占一成，2003年达到了13.00％，2006年已迅速提升到18.95％，至今约为20%。相对于流通企业规模的翻一番，零售企业的壮大更为迅猛：2000年连锁药店试点跨区发展时，全国只有医药零售企业数百家，旗下门店不到1万家；10年过去，零售企业已发展到2000多家，门店数量在全国近40万家药店中占据了1/3。令人叹为观止的还有，当时规模最大的连锁企业年销售额只有5亿多元，当今的连锁药店龙头却已突破30亿元，是原来的6倍。
入世前，医药商业受国家政策保护时间最长，即使是改革开放后，制药企业纷纷与外资展开合作，一批批合资药企早已驰骋中国市场，但是药品分销领域的变革始终不温不火，用“封闭”来形容当时情形恐不为过。或许是越落后，越爆发，入世的强烈冲击迫使医药商业公司磨刀霍霍。
平价药店在国有传统企业曾一统天下的市场中崛起，为药品分销领域的变革添加了最难以磨灭的印记。老百姓大药房于刚刚过去的10月份迎来了10周年庆典，于同一时期崛起的开心人大药房如今视网上药店为头等战略。两个平价药店先锋均已引入外资，前者牵手瑞典殷拓集团私募基金8200万美元，后者被花旗银行控股公司——日本日兴集团注入人民币1亿元风投。
外资对于2002、2003年那一场场平价药店掀起的降价风潮无疑甚为看重，他们看上的不仅仅是低价抢占市场的行为，还有因此而触发的商业变革之深远影响。平价药店打破了传统的药品供应链，渠道的扁平化引发了商业的变革，平价大旗拉下的不仅仅是虚高药价，也改写了工商之间的话语权，终端为王、渠道为尊等成为了现实。
老百姓和开心人让人见识到了民营企业之力量，九州通在流通渠道的崛起让更多民营企业相映生辉，后者在流通领域创新的快批、快配模式伸向了广阔的第三终端市场，为医药商业历史添上浓墨重彩的一笔。以至于九州通甫一上市，就被《财富》杂志收归“2011年中国500强排行榜”，在国有商业企业林立的榜单中一枝独秀。目前，九州通正在发展现代物流，将触角伸向了第一终端医院，对网上药店也已觊觎已久，意欲在未来的大市场、大流通格局中谋求更大的发展。
资本指向
在民营企业崛起的过程中，传统国有商业一度经历了管理成本高企、人才流失、机制僵化等带来的尴尬。但是新医改的迈步，为国企注入了新的政策推力。
为了规范医药流通市场，构建有效的医药流通新体系，国企重组走上了快马加鞭的征程，经过近10年的努力，已形成了国药集团、华润集团、上药集团、南京医药、广药集团等大型阵容，有些集团不光在商业领域攻城略地，业务也涵盖了生产和终端，国资魅力不可挡。
在这场轰轰烈烈的变革中，中小批发企业和零售企业饱受竞争压力，抱团取暖的行动也纷纷涌现，“联盟”趵突。
联盟现象最早出现在零售领域，当初只是中小连锁药店联采分销、降低成本的手段之一，后来发展到贴牌产品冲击品牌产品、联盟无处不在令人眼花缭乱。只是，新医改的缺“药”使得医药分开遥遥无期，让传统药店组成的联盟感受到了前所未有的危机。于是，各药店联盟在调整产品结构、满足会员转型大健康需求的同时，也从松散走向紧密，投入真金白银建立起一家家实体公司，成为资本运作大潮中另一道风景线。
被誉为类商业公司的药店联盟升级为实体公司，让医药批发企业如坐针毡，不少企业为摆脱被动之势，主动与各药店联盟携手合作，有的甚至出面组建新的联盟，涵盖渠道和终端，将更多的利益体捆绑在一起。
对于中下游的这场变革，上游企业同样不敢小觑，许多知名药企也展开积极行动，像以科伦医贸为首的科盟公司的出现，将商业的变革伸向更加丰富多彩的合纵连横空间，而在此过程中，资本同样成为不可或缺的纽带。
“入世10年里，该来的外资都已进来。”业内一位不愿具名的医药集团高层如此表示。业内分析认为，目前虽然已有不少外资进入，但是现有的流通企业规模仍然偏小，最大的医药商业企业规模也不过几百亿元，而且市场集中度偏低，在未来的竞争中，各路资金将如何洗牌，或许在未来的几年内可见分晓。
今年5月，成为医药流通行业主管部门不到两年的商务部，发布了我国自改革开放以来首部有关药品流通行业的规划纲要——《全国药品流通行业发展规划纲要（2011～2015）》，对提高行业集中度给出了具体目标：将在5年内，形成1～3家年销售额过千亿元的全国性大型医药商业集团、20家年销售额过百亿元的区域性药品流通企业，前三强的市场集中度须从目前的20%提升到30%以上；连锁药店在全部药店中的比重要从现在的1/3提升到2/3。
