长期研究粤港交通的中山大学港澳珠三角研究中心教授郑天祥认为，随着近年广、深等珠三角港口迅速冒起，香港港口目前已浮现四大劣势，“即使仍存的优势，亦随时会被追上”。
首先，今次香港码头罢工潮，即使最后涨薪幅度不足两位数，但导致本已成本高昂的香港港口“雪上加霜”，预计今后港口运营成本居高不下，较深圳、广州等珠三角码头的竞争力下降。
其次，以货柜车为代表的陆路货运呈式微之势，削弱衔接香港港口的竞争力。郑天祥分析说，以往香港与内地的油差价较大，香港货柜车北上相当于有“油补贴”，但随?近年两地油差价越来越接近，以前相当于年均60亿元的“油补贴”额，已压缩到目前的约20亿元，以致货柜车运营成本增加。而货柜车司机的月薪也由最旺时4万多元，跌到现在仅1万多元，年轻人不想入行，亦会逐步拖垮在港口业佔重要位置的货柜车行业。
高铁通车增穗货源
第三，随?广、深等珠三角港口网络日趋完善，将吸引珠三角乃至泛珠三角的货源越来越多就近进出口，进一步分薄香港的货源；加上货柜车陆运处于劣势，导致香港的货源趋窄。如广州港正不断完善陆路疏运系统，随?京广高铁通车，贵广、南广及厦深高铁加快建设运营，原先的线路将释放出更大货运运力，仅京广线便可增加1亿吨的货运量，加上南沙疏港铁路准备开工，这些都将促使广州港未来的货源大增。
第四，香港港口硬件设施亦开始滞后。如目前葵青货柜码头航道深度为负15米，已难以接纳运载量1.5万以上标箱的大型货轮靠泊，有香港学者提出要挖深到负17米，但目前香港政府却未有动工计划。反观珠三角码头航道正不断完善，如南沙货柜码头，航道水深已达负17米，未来还计划开挖负20米。
港十号码头纸上谈兵
郑天祥说，香港十号货柜码头都提了10多年仍无动静，“若不兴建，那么香港港口的吞吐能力就到此为止了，迟早将被广、深等港口追上。”即使香港政府想推动十号货柜码头建设，但现在投资商和财团未必感兴趣，除了成本高外，今次码头罢工潮亦损投资商的信心。
他直言，目前香港港口仍有竞争力的优势主要是航线航班密集，相比广、深等码头因国际班轮不够，部分货物要暂停留码头仓库，而香港码头一般可以一货到即可上船。
但近年珠三角码头也在班轮密度、作业效率等方面急起直追，如深圳港已有超过50家中外着名船公司开通国际货柜班轮航线239条。
