香港真正意义上的船舶注册作为港航业一个品种，被完整而独立地经营，始于1990年，屈指一算已20年，当时是基于现实营运环境的转变和考虑长远发展的需要，船东会一批资深的船东眼见“九七回归”问题浮现出来，在政权移交前后，香港船东的庞大船队，不能再靠英国船舶注册为法律依据，难免会在国际通商水域得不到船旗国合法而正当的法律保护，因而萌生了成立独立的香港船舶注册的构想，其后得到港英政府的肯定和赞同，于当年成立，但初期运作并不顺利，数量与规模小、知名度低，最大弊端是收费高、手续繁复，局面很难打开，以致出现海事处官员要上门向船东推销。
95年改革引入竞争元素
1995年船东会资深船东曹文锦、梁敏行等向政府倡议改革注册制度，提出注入：“增活力、好服务、低收费、手续简，一切为了提高竞争力”的新元素，自此之后，船舶注册才脱胎换骨，逐步发挥出新作用和效果，受到船东与港航业界的肯定好评。
翻查资料发现，九七年回归前后是香港船舶注册服务好坏的一个分水岭，由于船东对前景的忧虑和前途未明朗，撤船撤吨现象普遍，97年当年注册船艘跌至484艘，船总吨只剩565万总吨，创下了自有注册制度以来最低数字，甚至有本地船公司整支船队撤走的情况，注册制度面临危机，但自回归后，政局稳定，社会繁荣安定，营商环境好转，海事处改变经营船舶注册的工作作风，主动宣传，引入认证制度，种种积极因素所起的效果，逐渐打动了船东，更多航商认识了港船舶注册的好处，注册船舶和吨位开始回升，至2009年末统计，注册船舶1496艘，4490万总吨，若与20年前同期相比，船艘量上升了96%，船吨飙升6.15倍。
占七成船来自大中华区
船舶注册中心网上最新数字，截至今年10月7日，总船舶共1690艘，5460万总吨，仅今年头9个月，净增船182艘，净增总吨位894吨，升幅19.8%，接近两成。总船艘之中，约1451艘是远洋船。据海事处官员介绍，目前注册的船舶，估七成以上是来自大中华地区，换言之，内地来港注册的船舶有越来越多的趋势，平均每个月有20艘船注册。海事处还称，目前约有300万总吨的船正在办理注册，若以每艘7万总吨计，至少相等于43艘船。可以肯定说，香港船舶注册总量在今年年底前，还会进一步上升。
香港船舶注册有如此亮丽的成绩，20年来充满活力，究竟有什么法宝？除了该处标榜五大优点：一支专业优质的专家提供专业意见；全球税率最低；毋须为在海外缴交利得税，宽免双重课税；船员的国籍无限制，和最优质船务管理、融资法律及信息服务支持之外，还有更重要一点是离不开祖国的大力支持。
五大优点保质保量
另外，不少本地资深船东一致指出，香港船舶注册这项深得航商欢迎的政策，离不开内地中央政府的大力支持，多家国有大型航运企业把旗下相当部分方便旗船移到香港注册，以实际行动壮大该中心的实力与声势，一位海事处官员深有感慨地表示，船东是十分现实的，手上船队是否在一地撤走或注册，固然考虑的因素很多，香港船舶注册中心能够凭它的出众表现，成为全球最优质船舶注册地之一，反映了众多船东在一个方面对“一国两制”的肯定，并以实际行动投入信心的一票。
对“一国两制”的信心投票
马士基香港航运公司5、6月份间曾将20艘货柜船一次过转移香港注册，公司董事总经理达殊讲得最坦白。他说，马士基挂港旗船原有17艘，今次再增加22艘，至39艘，成为单一外资船公司最多在香港注册公司之一，原因很简单，一旦挂港旗可享受低的利得税和税收无须扣缴利息，这种财务上的得益降低成本经营开支，另外一个原因是改挂港旗船，相对在中国内地港口可获得港口收费优惠。据了解，香港船舶注册是以吨位分级来计算收费，最高收费亦不超过十万元。
