2009年10月月初，集团船舶靠泊和码头生产一度受到台风“莫拉克”影响，福州港务集团完成吞吐量343.97万吨，超月度计划近四成，同期比增达35.39%；累计今年前10月完成货物吞吐量3552.29万吨，已远超3000万吨的年度计划，同比增长53.1%，预计全年吞吐量将会突破4000万吨。

　　集装箱方面，集团10月完成集装箱吞吐量9.72万标箱，仅接近完成月度计划，同比下降1.37%；累计1到10月完成集装箱吞吐量94.79万标箱。

　　两马航线客运方面，由于空中直航的客源分流影响，进出港95航次，运输旅客4745人次，同比、环比均呈下降趋势，预计此趋势短期内仍将持续。&