11月22日晚上8时，广西新闽航集装箱班轮公司总经理(实际为总裁)吴志文宣布，广西新闽航公司旗下船舶停航，等待重组。
一位不愿具名的业内权威人士表示，目前广西新闽航也面临船东、码头、货主多方纠纷之中，公司也在积极处理。据该人士介绍，实际上11月22日晚上，吴志文宣布停运消息之后，也是在积极和各方协商处理善后问题。对于广西新闽航的债务，码头或船东存在扣箱的现象，故意把船停泊在海中不靠岸。
该人士认为，(码头或船东)无权扣船、扣箱，应依法处理。船东应依照航次义务按时靠泊卸货，货主可以通过起诉途径要求先行提货。
一位接近吴志文的人士告诉记者，广西新闽航经营困局早已经发生，而内贸航运大环境持续低迷是主要原因。与此前两家倒下的航运公司态度不相同，广西新闽航正在处理和船东、货主的多方纠纷，严冬之下，并无完卵，希望得到外界和媒体的宽容。
泉州港口局11月2日的一份广西新闽航名列泉州港运输奖励(补贴)第六批的公示企业名单显示，根据《泉州市人民政府促进泉州港集装箱运输发展的若干意见》等相关政策文件，广西新闽航挂靠围头码头，2014年度符合奖励(补贴)集装箱中转箱量26888TEU(标准集装箱)；2015年上半年符合奖励(补贴)集装箱中转箱量12429TEU。
泉州港口局相关人士表示，该补贴发放标准是按照泉州市相关文件进行发放，而发放针对的是2014年及2015年上半年，在此期间广西新闽航都是正常运营的，也符合相关补贴发放标准。
根据此前的公开资料，泉州港对于相关内贸箱的奖励标准为10元或20元一箱，依据此标准，即使按照20元最高标准算，广西新闽航能够拿到的奖励约78.6万元。对于该注册资本为2亿元的航运公司来说，78.6万元难以解决根本问题。
