无纸通关是企业使用格式化单证录入及转换软件，将纸质报关单证转化为格式化数据，通过“中国电子口岸”网络系统向海关进行电子申报；海关利用H883/EDI系统，在不改变现行通关作业总体流程的情况下，实现计算机电子审单和人工专业化无纸审单；企业在验放货物后向海关递交纸质单证，海关对纸质单证进行核对，并办理各类签证手续，签发报关单出口退税联、外汇核销联以及税、费缴纳凭证等。
