长江三角洲地区近年来经济社会发展活跃，口岸外贸和海关税收均已占中国总量的四成。
据海关总署统计，2006年，通过长三角口岸的进出口贸易达7147亿美元，比上年增长24．3％，约占全国外贸总额的41％，其中，约641亿美元的进出口来自长三角以外的其
他省区市；上海、南京、杭州、宁波四大直署海关2006年完成税收2458亿元人民币，比上年增长11．4％，占全国海关税收总额的40．3％。
2006年，长三角四大海关共监管进出口货运量4．18亿吨，审核报关单1711万份，比上一年分别增长10．8％和20．2％，分别占全国总量的23．7％和38．5％。
在深化通关作业改革方面，长三角地区海关近两年先后实施了提前报关、无纸通关、空运直通式通关、便捷通关、特定区域快速通关等项目。目前长三角地区海关网上税费支付业务已推广至12家银行，其中上海口岸税费电子化支付率已提高至72％。
长三角共有8个沿海主要港口、26个内河规模以上港口。
