根据交通部今年初制定的有关规划纲要，长三角地区将规划建设上海、南京、杭州、宁波、温州、徐州和连云港共7个国家级综合运输枢纽。
规划称，这7个国家级综合运输枢纽，以直辖市、省会城市、区域中心城市为依托，拥有主要港口、国家铁路和公路运输场站等基础设施，客货流量大、集散作用强、辐射范围广。
其中，上海、南京、宁波、温州、连云港为沿海综合运输枢纽，辐射国内，沟通国际，是内外贸货物运输和国际、省际人员流动的集散中枢，是提高长三角国际竞争力、参与经济全球化的重要基础设施，在长江中上游省区对外开放中也将发挥重要的支撑和带动作用；杭州、徐州为内陆综合运输枢纽，位于公路主骨架、内河主通道、铁路主干线的交汇处，是内陆地区的客货集散中心。
根据交通部的规划，作为长三角的龙头城市，上海的国家级综合运输枢纽建设主要以国际航运中心功能为主，突出发展国际集装箱运输，加快建设洋山港区、外高桥港区大型专业化集装箱码头及公路、铁路、内河集疏运通道，以港站主枢纽为依托发展现代物流园区，高速公路连通主要港区，并与外省市高速公路联网。
南京则以江海转运港为核心建设国家级综合运输枢纽，辐射周边及长江沿线、中南等地区。未来将发展大宗类物资转运、集装箱支线港，通过航道整治实现通达5万吨级海轮，高速公路连接主要港区，与上海、杭州、宁波等综合运输枢纽及周边城市相连。
杭州则侧重建设内陆综合运输枢纽，辐射浙江，连接上海和江苏、华南、中南等地，打通连接安徽等地的跨省通道，完善与上海、南京、宁波顺畅衔接的公路主通道，加快内河港口建设和航道整治，形成至上海的集装箱运输通道。
宁波作为多功能综合运输枢纽规划，承担上海国际航运中心集装箱运输，并与舟山共同承担长三角及长江沿岸地区能源及外贸大宗物资海进江的中转运输。未来重点发展大型化、专业化、集约化的集装箱、大宗散货码头，高速公路连港、铁路进港，实现港口与杭甬运河的有效衔接，形成快速高效的连接周边城市的高速公路通道。
温州、连云港、徐州的综合运输枢纽建设也都有各自的规划侧重点。此外，作为综合运输骨架网上第二层次的节点，国家还将在长三角规划布置一些区域性综合运输枢纽，定位于区域性的客货集散中心，依托中心城市，承担水路、公路等多种运输方式的有效衔接，推动长三角地区经济一体化发展，主要有苏州、无锡、镇江、南通、扬州、淮安、台州、金华、嘉兴、湖州、舟山、绍兴等城市。
综合运输枢纽是区域综合运输网络的节点和多种运输方式有效衔接的平台，是长三角实现一体化交通的核心，具有无缝高效衔接、零距离换乘的特点，是客货集散中心和现代化物流发展的重要平台。按照辐射范围大小，长三角综合运输枢纽分为国家级综合运输枢纽、区域性综合运输枢纽和一般枢纽三个层次。其中，长三角国家级综合运输枢纽是长三角区域内综合运输骨架网络最高层次的节点
