1、卡亚俄（Callao）

　　位于该国海岸中部，毗邻首都利马，是秘鲁最大港口，也是南美在太平洋的主要港口之一。全港总计有23个泊位。秘鲁对外贸易主要依靠该港口。近年来，因秘进出口贸易增长，其吞吐量不断提高，2010年达3100万吨，占全国港口吞吐总量的45%；集装箱吞吐量达134万标准箱，占全部港口的88%。秘鲁对外贸易有70%的商品都经由该港装卸。

　　2、派塔港（Paita）

　　位于皮乌拉大区派塔省，是秘鲁西北的重要综合性商港。水深10.67米，可系泊4艘1万吨的船只。港内有5个泊位，泊位上有些起重机，拖拉机，轨道拖车和货物铲车，还有拖船可使用。钢筋混凝土防波堤，长365米，宽36米。该港以特许经营权方式交由外资企业运营管理，2010年吞吐量达127万吨，其中集装箱货物吞吐量为96万吨，12.6万标准箱。

　　3、伊洛港（Ilo）

　　秘鲁南部重要港口，位于莫盖瓜大区伊洛省。第一海上油船泊位，北距伊洛镇0.5公里，有1根直径6英寸海底油管，将海上油船泊位与镇上炼油厂的贮油罐连接起来。该泊位还设有1根4英寸的输出鱼油的管道，用以出口鱼油。第二海上油船泊位，距伊洛市北面，有海底油管通向铜矿公司的贮油罐。第一海上油船泊位能系泊45000载重吨的油轮。2010年该港吞吐量282万吨，以液体散货为主，其次是干质散货，集装箱吞吐量为3.1万标准箱。

　　4、马塔拉尼港（Matarani）

　　位于该国南部阿雷基帕大区东南，秘鲁重要商港，是秘鲁政府通过转让特许经营权方式实施私营化的第一个多用途港口，现代化程度较高，港内吊机最大吊装重量达63吨。主要用于出口矿石、羊毛、咖啡、皮革等并进口杂货。2010年吞吐量达448万吨，主要是散货，集装箱吞吐量仅为1.8万标准箱。

　　5、伊基托斯港（Iquitos）

　　位于秘鲁洛雷托大区东北部，是亚马逊河上的重要港口。从巴西的亚马逊河河口港贝伦逆流而上，大概需要10-12天航程，因航道中有沙洲，中间可能需系泊待航两次。远洋轮全年可抵达，但易受到河水水位涨落的影响。